الأمراض المنقولة بالمياه هي الأمراض التي تنتقل بواسطة المياه الملوّثة عند استهلاكها للشرب أو الطهو (الكوليرا، وحمى التيفوئيد). يجدر التمييز بين الأمراض المنقولة بالمياه والأمراض ذات الصلة بالمياه والأمراض الناشئة من المياه. فالأمراض الناشئة من المياه التي تكون موئلاً للكائنات والطفيليات (كالبلهارسيا). أما الأمراض ذات الصلة بالمياه فتنتقل عبر الحشرات وليس بالاتصال المباشر بالمياه (كالملاريا وداء العمى النهري).