تُستخدم هذه التكنولوجيا للتصنيع على المستوى الجزيئي. وتفيد التكنولوجيا البيولوجية النانوية لمعالجة المادة والتحكم فيها على المقياس النانوي للاستفادة من الخصائص المتصلة بالحجم والبنية، والتي تختلف عن تلك المرتبطة بالذرات الفردية أو الجزيئات أو بالمواد الكتلية.